Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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