Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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