Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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