Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC13A2Q13183 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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