Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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