Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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