Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms