Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNB3Q05901 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms