Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms