Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DSC2Q02487 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms