Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAD23BP54727 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAD23BP54727 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAD23BP54727 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAD23BP54727 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAD23BP54727 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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