Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
THOP1P52888 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms