Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDC34P49427 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDC34P49427 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDC34P49427 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms