Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA4P43681 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA4P43681 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA4P43681 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA4P43681 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA4P43681 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA4P43681 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA4P43681 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA4P43681 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA4P43681 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA4P43681 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms