Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GGCXP38435 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms