Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGP37231 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms