Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms