Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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