Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms