Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM4SF1P30408 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM4SF1P30408 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms