Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms