Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms