Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF6P18850 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.1 ms