Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFTRP13569 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CFTRP13569 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFTRP13569 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFTRP13569 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFTRP13569 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFTRP13569 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CFTRP13569 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFTRP13569 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms