Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms