Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms