Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms