Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC172P0C7W6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms