Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTA1P02549 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms