Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3JO75822 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms