Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXN3O00409 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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