Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms