Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms