Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms