Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms