Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms