Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms