Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6E7

SIRT4, NAD-dependent protein lipoamidase sirtuin-4, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT4Q9Y6E7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT4Q9Y6E7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRT4Q9Y6E7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT4Q9Y6E7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms