Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms