Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX11Q9Y5W9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms