Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms