Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL3Q9Y4R7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms