Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms