Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9Y3F1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms