Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT52Q9Y366 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms