Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX2Q9Y2T7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms