Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P5

SLC27A5, Bile acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A5Q9Y2P5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC27A5Q9Y2P5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A5Q9Y2P5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A5Q9Y2P5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms