Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK3Q9Y2K2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms