Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNQ9UQP3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms