Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SATB2Q9UPW6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms